按照國務院國資委扁平化管理要求，一二五隊于2008年參加了局大公司改革，按要求取消和調整了四級單位管理體制，對人員、資產等進行了優化重組，原以隊為單位管理的經營單位基礎公司宜昌分公司、勘查院宜昌分院收歸局基礎公司和勘查院垂直管理，隊只負責基地管理及隊屬人員身份管理，原以隊為整體召開職代會、參與制訂各項重要經營管理政策、保障職工權益的方式被打破。如何在新形式下履行民主管理工作成了困擾黨委和工會的一道難題。隊黨委和工會沒有因體制變革而忘記責任，以高度的政治責任感履行職責，堅持站位謀為。隊黨委充分發揮政治核心作用，通過黨委成員分工參與經營單位決策、吸納各單位主要負責人參與黨委中心組學習，加強聯系及時了解經營單位發展動態，指導經營管理工作；統一部署組織各單位按黨風廉政建設要求述職述廉接受職工監督。隊工會充分發揮橋梁紐帶作用，一如既往支持各經營單位工作，堅定代表職工群眾利益，維護他們的合法權益，積極參與協調勞資關系，贏得了廣大職工群眾的信任。